ทิศทางหลักของการรักษาด้วยยาสำหรับโรคกล้ามเนื้อหัวใจอักเสบถูกกำหนดโดยการเชื่อมโยงหลักของการเกิดโรคกล้ามเนื้อหัวใจอักเสบ: การอักเสบที่เกิดจากการติดเชื้อ, การตอบสนองภูมิคุ้มกันที่ไม่เพียงพอ, การตายของเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจ (เนื่องจากเนื้อตายและโรคเสื่อมแบบก้าวหน้า, กล้ามเนื้อหัวใจแข็ง) และความผิดปกติของการเผาผลาญของเซลล์กล้ามเนื้อหัวใจ ควรคำนึงว่าในเด็กโรคกล้ามเนื้อหัวใจอักเสบมักเกิดขึ้นกับพื้นหลังของการติดเชื้อเรื้อรังในระยะโฟกัสซึ่งกลายเป็นพื้นหลังที่ไม่พึงประสงค์ (พิษและความไวของร่างกาย) มีส่วนสนับสนุนการพัฒนาและความก้าวหน้าของโรคกล้ามเนื้อหัวใจอักเสบ