การกำหนดปริมาณโดยตรงของ RNA ของ HIV ด้วย PCR ช่วยให้คาดการณ์อัตราการดำเนินของโรคในผู้ติดเชื้อ HIV ได้แม่นยำกว่าการกำหนดจำนวนเซลล์ CD4+ และด้วยเหตุนี้ จึงสามารถประเมินการอยู่รอดของผู้ป่วยได้แม่นยำยิ่งขึ้น จำนวนอนุภาคไวรัสที่สูงมักสัมพันธ์กับความบกพร่องทางภูมิคุ้มกันอย่างรุนแรงและจำนวนเซลล์ CD4+ ที่ต่ำ