การรักษาภาวะติดเชื้อในกระแสเลือดอย่างมีประสิทธิผลสามารถทำได้โดยการผ่าตัดทำความสะอาดบริเวณที่ติดเชื้อให้สะอาดและให้ยาต้านจุลชีพอย่างเพียงพอ การรักษาด้วยยาต้านจุลชีพในระยะเริ่มต้นที่ไม่เพียงพอเป็นปัจจัยเสี่ยงต่อการเสียชีวิตในผู้ป่วยภาวะติดเชื้อในกระแสเลือด