อาการของโรคอาหารไม่ย่อยประกอบด้วยกลุ่มอาการหลายอย่างรวมกัน ได้แก่ กลุ่มอาการปวด กลุ่มอาการอาหารไม่ย่อย และท้องเสีย กลุ่มอาการอาหารไม่ย่อยมักเกิดจากอาหารเป็นพิษเฉียบพลัน โรคซัลโมเนลโลซิส โรคเอสเชอริชิโอซิส โรคเยอร์ซิโนซิสในระบบทางเดินอาหาร โรคกระเพาะและลำไส้อักเสบจากโรต้าไวรัส และท้องเสียจากไวรัสชนิดอื่น ๆ ซึ่งเป็นระยะเริ่มต้นของโรคโบทูลิซึม และอาจเกิดได้ในระยะก่อนเป็นไข้จากไวรัสตับอักเสบ
