การตรวจจับและแยกแยะโปรโตซัว (การแยกแยะรูปแบบที่ก่อโรคจากรูปแบบที่ไม่ก่อโรค) เป็นงานที่ค่อนข้างซับซ้อน สิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวส่วนใหญ่ในอุจจาระพบได้ในสองรูปแบบ: ระยะการเจริญเติบโต (ระยะโทรโฟโซอิต) - เคลื่อนไหวได้ มีชีวิต ไวต่อผลกระทบที่เป็นอันตรายได้ง่าย (โดยเฉพาะอย่างยิ่งการระบายความร้อน) และจึงตายอย่างรวดเร็วหลังจากขับถ่ายออกจากลำไส้ และในรูปแบบของซีสต์ (โอโอซิสต์) ที่ต้านทานต่ออิทธิพลภายนอก