แม้ว่าแตงกวาจะมีสรรพคุณมากมาย แต่ก็ไม่แนะนำให้รับประทานเพื่อรักษาโรคกระเพาะ เนื่องจากแตงกวาต้องการน้ำย่อยในกระเพาะมาก และอวัยวะที่เป็นโรคไม่สามารถผลิตน้ำย่อยเหล่านี้ได้ นอกจากนี้ กรดไฮโดรคลอริกที่มากเกินไปอาจทำให้เกิดแผลในกระเพาะได้หากกรดในกระเพาะมีความเข้มข้นสูง